（1）细胞中的RNA主要分布在细胞质中．如图中3线粒体基质、4细胞质基质、6叶绿体基质中．天气晴朗时，植物细胞的光合作用大于呼吸作用，因此线粒体呼吸作用产生的CO2将会扩散到细胞质基质中、进而进入叶绿体中北光合作用利用，对应图中标号h、c．
（2）线粒体是进行有氧呼吸的主要场所，线粒体基质是有氧呼吸第二阶段的场所，线粒体内膜是第三阶段的场所．若物质X为丙酮酸，丙酮酸将进入线粒体中参与第二阶段的反应，则会到达线粒体的基质中；若物质X为[H]，[H]将会在第三阶段与氧气结合生成水，因此其到达线粒体的内膜上．
（3）细胞膜的基本支架是磷脂双分子层，细胞膜从土壤中吸收NO3-、NH4+等离子的方式主要是主动运输．植物体内缺乏氮元素时，会影响叶绿体内叶绿素和酶（或蛋白质）二类化合物的合成，影响了植物的光合作用速率．
故答案为：
（1）3、4、6 h、c
（2）3 2
（3）磷脂双分子层 主动运输 叶绿素 酶（或蛋白质）
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