A、纯净物按元素的含有情况可分为化合物与单质，属于并列关系．故A错误；B、化学反应包括多种类型的反应，其中包括化合反应．属于化学反应与化合反应属于包含关系．故B错误；C、原子核和核外电子构成原子，所以原子与原子核是包含关系．故C正确；D、该选项的答案不唯一，例如：单质与化合物属于并列关系等．故答案是：C；单质与化合物属于并列关系等．
