A、鱼属于鱼类，体内有脊柱，是脊椎动物；蜜蜂是节肢动物、涡虫是扁形动物，体内都无脊椎骨组成的脊柱，属于无脊椎动物，A错误；
B、蝙蝠属于哺乳类、乌龟属于爬行类，体内都有脊柱，是脊椎动物；蝴蝶是节肢动物、体内无脊椎骨组成的脊柱，属于无脊椎动物，B错误；
C、螃蟹是节肢动物、蚯蚓是环节动物，体内都无脊椎骨组成的脊柱，属于无脊椎动物；家鸽体内有脊柱，是脊椎动物，C错误；
D、水母是腔肠动物、河蚌是软体动物、蜘蛛是节肢动物，体内都无脊椎骨组成的脊柱，属于无脊椎动物，D正确．
故选：D．
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