工商行政管理局对企业不予年检通过，是否可以对其提起行政诉讼？

不可以，因为不予年检通过，一般是让你补足材料。它不是具体的行政行为，法院不会受理。
如果你企业因为没有通过年检，工商局吊销你的执照，起诉是可以的。

引用：对不予通过年检企业的处理

对申报年检的企业进行审查后，绝大部分企业会顺利通过年检，继续开展经营活动，但会有极少数企业不予通过年检。对此，工商行政管理机关将依法吊销其营业执照。具体情况如下：

（一）企业实收资本未达到法律法规规定的最低限额的，不予通过年检。《中华人民共和国公司法》规定，有限责任公司注册资本的最低限额是，以生产经营为主和以商品批发为主的公司为人民币50万元；以商品零售为主的公司为人民币30万元；科技开发、咨询、服务性公司为人民币10万元。股份有限公司的注册资本最低限额为1000万元。《中华人民共和国企业法人登记管理条例》规定非公司企业法人注册资金不得少于3万元。

（二）企业实收资本虽达到法律、行政法规规定的最低限额，但与注册资本相差悬殊的，不予通过年检。

（三）年检中发现有其他严重违法、违规行为，符合吊销营业执照条件的，不予通过年检。

对上述情况，工商行政管理机关将督促企业在限期内补足注册资本（金），完善基本登记条件，对逾期不改正的，将依法吊销其营业执照或限期办理注销登记。

在年检中，工商行政管理机关如发现分公司或不具有法人资格的营业单位其上级公司或企业法人已经注销或被吊销了营业执照，也将不予通过年检，限期办理注销登记，逾期不办的，吊销其营业执照。

可以倒是可以，但你公司年检时提供的材料是不是有问题呢？是不是虚假材料呢？等等。
比如，损益表、负债表，我想没几个公司提供的是真实的。你胜诉的几率很小。

不可以

是什么原因对企业不予年检通过，能说明一下吗？