首先，固定头架：Leksell立体定向坐标头架用可调柱和固定螺丝(螺杆)固定到病人的头部。在治疗期间，用头架将患者的头部固定不动并安置在准直器头盔内，从而为测定靶点(靶组织)坐标提供了可靠的依据。
其次，图象扫描采集(定位)：固定好头架后，接下来做与所用图象格式兼容的相关检查，可以是血管造影、CT、MRI等。采集到一系列图象并传输到治疗计划系统：LGP(Leksell GammaPlan®)。这样，就将靶点(靶组织)的位置固定下来了，它的x、y、z坐标也就被确定下来。
再次，计算机化治疗计划设计：一旦图象被导入到治疗计划系统，患者的病变部位(病理学特征)就被描述出来。为了达到与病变立体形态(几何学)相符合的剂量分布，以二维、三维显示的病变部位为中心放置多重等角点。各种尺寸准直器的联合作用、选择性射束阻挡、加权分析等确保了放射治疗部位正好与靶组织相符合。
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